Dans ses observations générales, la Cour se montre sceptique face à l'objectif d'un retour des finances publiques à l'équilibre en 2010, comme s'y  est engagé le gouvernement.

Y sont aussi épinglées les urgences médicales pour un pilotage "incohérent", des systèmes d'information "déficients" et une "insuffisance de l'articulation" avec les médecins de ville. Le rapport relève que "d'importantes inégalités territoriales subsistent" dans l'accès aux soins palliatifs qui  restent trop souvent réservés aux patients atteints d'un cancer.

La gestion des fonds publics par la Polynésie française fait l'objet d'un réquisitoire implacable visant les dernières années de Gaston Flosse (UMP) à la  tête du territoire, marquées par une "administration parallèle" et des "dérives" financières.

La Cour pointe les carences de la collecte des contributions  patronales à la formation professionnelle continue, les aides personnelles au logement, dont le rapport dénonce les conditions d'attribution et la "dégradation de leur efficacité sociale", ou encore les prêts bonifiés aux agriculteurs dont les procédures sont jugées "lourdes" et "difficilement contrôlables".

La Cour des comptes  remarque dans un rapport sur la rétention des étrangers en situation irrégulière que "la relance de la politique d'éloignement du territoire" a été engagée "avant même que l'adaptation nécessaire des capacités des centres de rétention ne soit assurée".

De même, la Cour estime que "le respect de l'excercice des droits des étrangers retenus reste incomplet".

La cour dénonce également la politique publique de lutte contre  l'alcoolisme, qu'elle juge entravée par "le poids économique du secteur de la  production et de la commercialisation de l'alcool".

Elle met en garde contre la situation financière "grave" de Cap'Découverte, un parc multiloisirs du Tarn, et  "l'insuffisance de rentabilité" du Futuroscope de Poitiers